AM-C活性化剤は多様な化学物質を包含し、主に細胞接着、炎症、そしてこれらの過程に関連するシグナル伝達経路の調節に焦点を当てている。これらの活性化剤はJAM-Cに直接結合するわけではないが、細胞環境や細胞接着や遊走を制御する経路の活性を変化させることにより、その機能に影響を与える。これらの化学物質が効果を発揮するメカニズムは様々で、cAMPレベルの調節(フォルスコリンで見られる)から炎症反応の調節(レスベラトロール、クルクミンなど)まで多岐にわたる。
JAM-Cは内皮細胞の透過性、白血球の遊走、癌の転移など複数の過程に関与しているため、JAM-Cの機能に影響を及ぼすこれらの活性化因子の有効性は、特定の細胞状況に依存する可能性がある。これらの活性化因子は通常、JAM-Cの発現をアップレギュレートするシグナル伝達経路を増強するか、あるいはJAM-Cを介した接着を助長するように細胞環境を変化させることによって作用する。例えば、PMAによるプロテインキナーゼCの活性化は、JAM-Cに影響を及ぼす事象のカスケードを導き、一方、EGCGによる炎症の調節は、JAM-Cが活動する細胞環境を変化させる。
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