IRGC1は、リン酸化を伴う様々な細胞内シグナル伝達経路を通じて、その活性を調節することができる。フォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)はプロテインキナーゼC(PKC)を刺激することで知られており、PKCはIRGC1を含む多くのタンパク質をリン酸化することができる重要なキナーゼである。同様に、ジアシルグリセロール(DAG)の合成アナログである1,2-ジオクタノイル-sn-グリセロール(DiC8)は、IRGC1を標的とする可能性のあるPKCアイソフォームを活性化する。フォルスコリンは、細胞内のcAMPレベルを上昇させることにより、プロテインキナーゼA(PKA)を活性化し、IRGC1を直接リン酸化してその機能を調節することができるもう一つのキナーゼである。さらに、上皮成長因子(EGF)はその受容体に関与して、Ras/Raf/MEK/ERK経路の活性化をもたらすカスケードを開始し、IRGC1のリン酸化にもつながる。
イオノマイシンは、細胞内カルシウムレベルを上昇させることにより、カルモジュリン依存性キナーゼ(CaMK)を活性化し、IRGC1をリン酸化することができる。SERCAポンプ阻害剤であるタプシガルギンもまた、細胞質カルシウムレベルを上昇させ、CaMKの活性化とそれに続くIRGC1のリン酸化につながる可能性がある。タンパク質合成を阻害するアニソマイシンは、JNKやp38などのストレス活性化MAPK経路を活性化し、IRGC1をリン酸化する可能性がある。過酸化水素はシグナル伝達分子として、キナーゼやホスファターゼの活性を調節し、IRGC1のリン酸化状態を変化させる可能性がある。タンパク質リン酸化酵素の阻害剤であるオカダ酸やカリクリンAは、タンパク質をリン酸化状態に維持し、間接的にIRGC1の活性化状態をサポートする。最後に、14-3-3タンパク質とその標的間の相互作用を安定化するフシコシンは、14-3-3タンパク質と相互作用すれば、IRGC1の活性化を促進する可能性がある。cAMPアナログであるジブチリル-cAMPも同様にPKAを活性化し、PKAはIRGC1をリン酸化して活性に影響を与える。
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