Los inhibidores químicos del INTS5 pueden interferir con su función en diversos procesos celulares dirigiéndose a diferentes mecanismos dentro de la célula. El paclitaxel, al estabilizar los microtúbulos, puede interrumpir la progresión del ciclo celular, lo que a su vez puede provocar una inhibición del INTS5, ya que su función depende del ciclo celular. La oligomicina A afecta al INTS5 al inhibir la ATP sintasa mitocondrial, reduciendo así los niveles de ATP necesarios para los procesos dependientes de la energía en los que participa el INTS5. Del mismo modo, la Brefeldina A puede impedir la función del INTS5 al interrumpir el transporte entre el retículo endoplásmico y el aparato de Golgi, lo que puede conducir a una localización errónea del INTS5 o de sus sustratos. La camptotequina y el etopósido, ambos dirigidos contra las topoisomerasas, pueden inhibir indirectamente el INTS5 al interferir en la replicación y transcripción del ADN, reduciendo la disponibilidad de los sustratos de ARNm necesarios para su procesamiento.
Por otro lado, la cicloheximida, al inhibir la síntesis de proteínas, puede afectar indirectamente al INTS5 debido a la menor disponibilidad de proteínas sustrato que el INTS5 procesaría normalmente. La leptomicina B actúa inhibiendo la exportación nuclear, lo que puede tener un impacto directo en la función del INTS5 dentro del núcleo en el procesamiento del ARNm. El papel de la mitomicina C en la formación de aductos de ADN puede afectar a la transcripción, afectando así a la capacidad del INTS5 para procesar ARNm. La actinomicina D impide la transcripción por la ARN polimerasa, lo que conduce a una disminución directa de los sustratos de ARN del INTS5. La toxina pertussis altera las vías de señalización celular, lo que puede afectar a la regulación de la actividad del INTS5 en el procesamiento del ARNm. La triptolida, al inhibir la ARN polimerasa II, reduce la transcripción génica, reduciendo posteriormente la participación del INTS5 en el procesamiento del ARNm. Por último, la inhibición de la glicosilación ligada a N por parte de la tunicamicina puede afectar al plegamiento y funcionamiento de proteínas que son necesarias para el papel del INTS5 en el procesamiento del ARNm.
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