HoxB9活性化物質には、HoxB9に直接結合したり機能を増強したりはしないが、HoxB9が関与するシグナル伝達経路に作用することで間接的にその活性に影響を与えることができる様々な化学物質が含まれる。PI3K/Akt/mTOR経路の活性化因子であるインスリン、AMPK活性化因子であるメトホルミンとAICAR、オメガ3脂肪酸のエイコサペンタエン酸(EPA)とドコサヘキサエン酸(DHA)、ポリフェノールのレスベラトロール、クルクミン、ケルセチンはすべて、PI3K/Akt/mTOR経路を刺激することができる。この経路はHoxB9によって利用されることが知られているため、これらの化学物質によるこの経路の活性化は、間接的にHoxB9活性の上昇につながる可能性がある。
さらに、アデニル酸シクラーゼを活性化してcAMPレベルを上昇させるフォルスコリン、PKA活性化物質であるH-89、およびプロテインキナーゼC(PKC)の強力な活性化物質であるホルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)は、PI3K/Akt/mTOR経路と相互作用することができるため、HoxB9の間接的なアップレギュレーションにつながる。さらに、カルシウムキレーターであるBAPTA-AMは、カルシウム依存性CaMK経路への作用を通して、間接的にHoxB9の活性に影響を与える。これらの化学物質がそれぞれの標的と相互作用すると、シグナルは一連の分子間相互作用を介して伝達され、最終的にはPI3K/Akt/mTOR経路に影響を与え、ひいてはHoxB9の活性を調節する。これらの化学物質は、HoxB9が属するシグナル伝達経路を調節し、それによってHoxB9の活性に影響を与える能力を持っているため、間接的なHoxB9活性化物質とみなすことができる。
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