As substâncias químicas que conduzem indiretamente à ativação funcional da proteína GRAP fazem-no através da modulação de várias vias de sinalização e processos celulares em que se sabe que a GRAP está envolvida. O cloreto de lítio, por exemplo, inibe a glicogénio sintase quinase 3 (GSK-3), um regulador negativo da via de sinalização Wnt. Esta inibição pode levar à estabilização e acumulação de β-catenina, um componente que pode conduzir à transcrição de vários genes, potencialmente incluindo GRAP, aumentando assim a sua expressão e atividade. A forskolina, o isoproterenol e o IBMX actuam para aumentar os níveis de AMP cíclico (cAMP) nas células, o que ativa a proteína quinase A (PKA). A ativação da PKA pode levar a uma série de efeitos a jusante, incluindo a fosforilação de proteínas que podem aumentar o estado de ativação ou a expressão da GRAP.
Do mesmo modo, a ionomicina, ao aumentar os níveis de cálcio intracelular, pode ativar vias de sinalização dependentes do cálcio, que podem influenciar a atividade do GRAP. O TPA é um ativador bem conhecido da proteína quinase C (PKC), que desempenha um papel significativo na sinalização intracelular e pode fosforilar proteínas dentro da via Ras-MAPK onde o GRAP funciona. O dibutiril-AMP, como análogo do AMPc, tem uma função semelhante à da forskolina, activando a PKA e afectando potencialmente a atividade do GRAP. A anisomicina actua como um ativador da proteína quinase activada pelo stress, o que pode levar à ativação da via MAPK, resultando possivelmente na ativação do GRAP através do seu envolvimento nesta via. O ortovanadato de sódio actua como inibidor da fosfatase, o que pode levar a um aumento dos níveis de fosforilação na célula, afectando várias vias de sinalização, incluindo as vias de que o GRAP faz parte. O Ácido Okadaico, ao inibir as proteínas fosfatases, pode também resultar num aumento da sinalização de fosforilação, afectando potencialmente o estado de ativação do GRAP. O Piceatannol e o LY294002 modulam a atividade da quinase, influenciando assim as vias de sinalização e conduzindo possivelmente a alterações no estado de ativação do GRAP, uma vez que estas quinases fazem parte das complexas redes de sinalização celular em que o GRAP está envolvido.
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