FAM48B2の化学的活性化因子は、様々な細胞内シグナル伝達経路を利用してその活性化を促進する。フォルスコリンは、細胞内のcAMP濃度を上昇させることにより、プロテインキナーゼA(PKA)の活性を間接的に刺激する。PKAは、FAM48B2を含む広範な細胞標的をリン酸化し、その活性状態を変化させることが知られている。これと同様に、IBMXとジブチリル-cAMPは、それぞれcAMPを分解するホスホジエステラーゼを阻害することによって、あるいはcAMPアナログとして作用することによって、cAMPレベルを上昇させ、PKA活性を持続させ、FAM48B2のリン酸化とそれに伴う活性化を促進する。さらに、プロテインキナーゼC(PKC)を活性化するPMAを作用させることで、もう一つのリン酸化経路が得られる。PKCは広範なタンパク質を標的としており、この作用はFAM48B2のリン酸化にも及び、その活性を調節する。
一方、カルシウムシグナルは細胞機能の調節において極めて重要な役割を果たしており、イオノマイシンやA23187のようなイオノフォアは細胞内カルシウム濃度を上昇させる。このカルシウムイオンの急増は、カルモジュリン依存性キナーゼ(CaMK)を活性化し、多くのタンパク質のリン酸化を引き起こすが、その中にはFAM48B2も含まれる。タプシガルギンは、小胞体/小胞体Ca2+ ATPase(SERCA)を阻害することによってカルシウムのホメオスタシスを破壊し、細胞質カルシウムの上昇に寄与する。さらに、オカダ酸やカリクリンAのようなタンパク質リン酸化酵素阻害剤は、タンパク質の脱リン酸化を防ぎ、FAM48B2をリン酸化された活性状態に維持する。さらに、アニソマイシンは、JNKのようなストレス活性化プロテインキナーゼ(SAPK)の活性化を通して、FAM48B2を含む調節タンパク質のリン酸化を引き起こす。フシコシンは、14-3-3タンパク質とそのパートナーとの間の会合を安定化させることによって、FAM48B2が14-3-3タンパク質相互作用ネットワークの一部である場合、FAM48B2の活性化状態にも影響を及ぼす可能性がある。スタウロスポリンは、一般的なキナーゼ阻害剤であるにもかかわらず、低濃度では特定のキナーゼを活性化し、FAM48B2が関与するリン酸化イベントのカスケードを引き起こす可能性がある。
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