DNA pol δ ss 抑制因子

常见的DNA多聚酶δ抑制剂包括但不限于2'-脱氧-2',2'-二氟胞苷（CAS 95058-81-4）、1-β-D-阿拉伯呋喃糖胞嘧啶（CAS 147-94-4）和3′-叠氮-3′-脱氧胸苷（CAS 30516-87-1）。

DNA聚合酶δ单链（pol δ ss）抑制剂是一类化合物，专门用于抑制DNA聚合酶δ与单链DNA（ssDNA）相互作用时的活性。DNA聚合酶δ是DNA复制和修复过程中的一种重要酶，主要负责复制过程中滞后链的合成。它在确保DNA合成的准确性和效率方面起着至关重要的作用。在复制过程中，DNA聚合酶δ与单链DNA模板结合，添加核苷酸，从而延长冈崎片段。DNA聚合酶δ单链抑制剂通常通过结合活性位点或负责与单链DNA模板相互作用的区域，从而阻断其添加核苷酸的能力，从而靶向酶与单链DNA的活性相关的特定区域。这些抑制剂可以通过与天然底物竞争来发挥竞争性作用，也可以通过结合改变酶功能的变构位点来发挥非竞争性作用。DNA pol δ 单链抑制剂的设计重点是确保该酶在单链结合模式下的特异性，减少对可能以不同模式运作的其他聚合酶的潜在影响。

DNA pol δ 单链抑制剂的开发需要对酶的结构有全面的了解，特别是参与识别和催化单链DNA的区域。利用X射线晶体学或冷冻电子显微镜（cryo-EM）进行的高分辨率结构研究，能够详细揭示DNA聚合酶δ的活性位点和单链DNA结合界面，从而确定适合抑制剂结合的关键域和相互作用位点。然后，利用分子对接和分子动力学模拟等计算建模技术来预测潜在抑制剂与DNA聚合酶δ之间的相互作用，优化其结合亲和力和选择性。通常会修饰抑制剂，使其包含增强特定相互作用的官能团，例如与催化残基的氢键或稳定抑制剂-酶复合物的疏水接触。采用结构-活性关系（SAR）分析来反复优化化学结构，从而改善溶解度、稳定性和对单链DNA结合的选择性等性质。DNA聚合酶δ的单链抑制剂可能包括从精确匹配活性位点的小有机分子到能够与酶的多个功能区域相互作用的更复杂分子，从而确保有效破坏其与单链DNA模板的活性。这些抑制剂的开发结合了先进的结构生物学、化学合成和计算技术，以详细理解DNA聚合酶δ在滞后链合成中的作用及其与单链DNA的相互作用。