Chemische Inhibitoren von DEPDC4 können über verschiedene Mechanismen seine Aktivität hemmen, indem sie in die Signalwege des Proteins eingreifen. Staurosporin ist als potenter Kinaseinhibitor bekannt, der Phosphorylierungsvorgänge verhindern kann, die für die DEPDC4-Funktion wesentlich sind. Diese Hemmung ist direkt, da Phosphorylierung eine posttranslationale Modifikation ist, die Proteine aktivieren oder deaktivieren kann. In ähnlicher Weise zielt Bisindolylmaleimid I auf die Proteinkinase C ab, eine Kinase, die wahrscheinlich an der Phosphorylierung von DEPDC4 oder von Proteinen innerhalb seiner Signalkaskade beteiligt ist. Durch Hemmung dieser Kinase reduziert Bisindolylmaleimid I die Phosphorylierung und anschließende Aktivierung von DEPDC4. LY294002 und Wortmannin, beides PI3K-Inhibitoren, verringern die Kinaseaktivität stromaufwärts von DEPDC4, was zu einer Verringerung der Signalwege führt, die sonst zu seiner Aktivierung beitragen würden. Dies ist besonders wichtig, da PI3K an einer Vielzahl von Signalwegen beteiligt ist, die zelluläre Funktionen regulieren, zu denen auch die Regulierung von Proteinen wie DEPDC4 gehören kann.
Darüber hinaus unterdrücken U0126 und PD98059, beides MEK-Inhibitoren, den MAPK/ERK-Signalweg, von dem bekannt ist, dass er zur Regulierung von Proteinen beiträgt, die mit DEPDC4 interagieren oder sich in demselben Signalweg wie DEPDC4 befinden. Diese Unterdrückung führt zu einer Abnahme der funktionellen Aktivität von DEPDC4. Die Hemmung von mTOR, einem wichtigen Regulator des Zellwachstums, durch Rapamycin hat ähnliche nachgelagerte Effekte, zu denen auch die Verringerung der DEPDC4-Aktivität gehört, da die mTOR-Signalübertragung für die Aktivierung vieler zellulärer Proteine entscheidend ist. Der JNK-Inhibitor SP600125 und der p38-MAPK-Inhibitor SB203580 hemmen in ähnlicher Weise Kinasen, die wahrscheinlich Substrate innerhalb der Signalwege von DEPDC4 phosphorylieren und dadurch dessen Aktivität verringern. Der Src-Kinase-Inhibitor PP2 unterbricht die Aktivität von Kinasen, die DEPDC4 phosphorylieren können, und verringert so seine Aktivität. Dasatinib wirkt umfassend auf Kinasen der Src-Familie und auch auf BCR-ABL, deren Hemmung zu einer verminderten DEPDC4-Aktivität führen kann, indem sie die Phosphorylierungskaskaden verringert. Erlotinib schließlich hemmt die EGFR-Tyrosinkinase, die Teil der Signalwege ist, an denen DEPDC4 beteiligt ist, und durch die Hemmung des EGFR kann Erlotinib zu einer indirekten Hemmung der DEPDC4-Aktivität führen. Jeder dieser Wirkstoffe zielt auf spezifische Kinasen oder Signalwege ab, die, wenn sie gehemmt werden, zu einer verringerten Aktivität von DEPDC4 führen, indem die für seine Funktion entscheidende Phosphorylierung eingeschränkt wird.
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