Os inibidores da DENND2C englobam um conjunto diversificado de entidades químicas que impedem indiretamente a atividade da DENND2C através de vários mecanismos celulares. A esturosporina e a bisindolilmaleimida I, por exemplo, têm como alvo os eventos de fosforilação mediados pela proteína quinase C, essenciais para que o DENND2C exerça o seu papel na ativação das Rab GTPases e nas vias endocíticas subsequentes. Ao reduzir a função da PKC, estes inibidores interrompem efetivamente a sinalização ascendente necessária para o tráfico de vesículas mediado por DENND2C. Da mesma forma, o inibidor de ROCK Y-27632 e o inibidor seletivo de Cdc42 ML 141 prejudicam a dinâmica do citoesqueleto necessária para o envolvimento de DENND2C na dinâmica da membrana, levando a uma redução do papel funcional da proteína no tráfico intracelular. O LY 294002, um inibidor da PI3K, atenua o recrutamento da DENND2C para as membranas celulares, reduzindo assim a sua atividade catalítica em relação às Rab GTPases. Além disso, Wiskostatin e ZCL278, ao inibirem N-WASP e Cdc42, respetivamente, desestabilizam a estrutura de actina necessária para a função de DENND2C, destacando a intrincada relação entre a organização do citoesqueleto e a atividade de DENND2C.
O arsenal de inibidores de DENND2C também inclui compostos que perturbam vários aspectos do tráfico vesicular, um processo ao qual DENND2C está intrinsecamente ligado. A brefeldina A, por exemplo, impede o ciclo ARF-GTPase, obstruindo assim os processos de formação e transporte de vesículas em que o DENND2C é um ator crítico. A SecinH3 perturba o tráfico dependente de ARF ao visar as citoesinas, que, por sua vez, podem bloquear as vias ascendentes ao domínio de ativação da Rab GTPase de DENND2C. Exo1, ao dificultar o complexo exocisto, afecta diretamente os eventos de ligação e fusão de vesículas subsequentes à atividade de DENND2C, reduzindo assim a influência da proteína nestes processos. Por fim, Gö 6976 e NSC 23766 interferem no citoesqueleto de actina e na sinalização da GTPase Rac1, respetivamente, ambos cruciais para a plena expressão funcional de DENND2C no movimento vesicular e na dinâmica do citoesqueleto, ilustrando ainda mais a amplitude de mecanismos empregados pelos inibidores de DENND2C para reduzir a atividade da proteína nas vias de tráfico celular.
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