DDX19Bの化学的阻害剤は、ATP加水分解やRNA結合など、RNAの核細胞質輸送に関与するヘリカーゼ活性に不可欠なタンパク質の機能を標的とする。ノボビオシンは、DDX19BのATPaseドメインに結合することで同様の機能を果たし、それによってRNAヘリカーゼ機能に必要な構造変化を阻害する。オーリントリカルボン酸は、DDX19Bの核酸結合部位に結合し、タンパク質とRNAの相互作用を阻害することによってDDX19Bを阻害する。核酸構造への干渉は、臭化エチジウムやベルベリンなどの阻害剤が採用するもう一つの戦略である。これらの化合物は核酸とインターカレートし、その構造を変化させるので、DDX19Bが基質と結合したり、その基質をほどいたりする能力を阻害する。
アムサクリンやミトキサントロンのような化学物質も、同様の方法でDDX19Bの機能を阻害する。DNAに挿入することによって、DDX19Bが効果的に関与できないような歪んだ核酸構造を作り、それによってヘリカーゼの働きを妨げるのである。アクチノマイシンDはDNAに結合してDNA依存性RNA合成を阻害し、立体障害によるDDX19Bの阻害につながり、タンパク質がRNA基質と相互作用するのを妨げる。スラミンとヘパリンは異なるメカニズムでDDX19Bを阻害する。それらはタンパク質に結合し、ヘリカーゼ活性に不可欠なRNA基質との相互作用を阻害する。オキサリプラチンはDNA付加体と架橋を形成し、DDX19Bが容易にほどけないため、タンパク質のヘリカーゼ活性を阻害する。最後に、ダウノルビシンはDNAへのインターカレーションを通してDDX19Bの巻き戻し作用を阻害し、その結果、RNAの核細胞質輸送におけるタンパク質の役割を阻害する。
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