La forskoline et le dibutyryl-cAMP augmentent l'AMP cyclique intracellulaire (AMPc) qui, à son tour, active la protéine kinase A (PKA). L'activation de la PKA entraîne la phosphorylation de multiples substrats, ce qui peut avoir un impact sur le transport vésiculaire médié par COG4. En outre, des composés tels que le 8-Bromo-cAMP sont des analogues de l'AMPc qui stimulent directement la PKA, en contournant les récepteurs cellulaires et en exerçant ainsi un effet plus immédiat sur les voies qui régissent le rôle de COG4 dans le trafic membranaire. L'ionomycine, par sa capacité à augmenter les niveaux de calcium intracellulaire, déclenche des cascades de signalisation dépendantes du calcium qui pourraient s'entrecroiser avec les fonctions régulatrices de COG4. Les polyphénols tels que l'épigallocatéchine gallate (EGCG) et les esters de phorbol tels que le phorbol 12-myristate 13-acétate (PMA) activent la protéine kinase C (PKC). La signalisation de la PKC peut conduire à une série d'événements de phosphorylation qui ont le potentiel de moduler l'activité de COG4, affectant indirectement le trafic et le tri des vésicules dérivées du Golgi.
Le LY294002, un inhibiteur de PI3K, ainsi que le PD98059 et le butyrate de sodium, qui inhibent respectivement la MEK et les histones désacétylases, modifient diverses voies de signalisation et profils d'expression génique. Ces changements peuvent entraîner une modification de la fonction de COG4, mettant en évidence le réseau complexe de signaux intracellulaires qui régissent son activité. L'acide rétinoïque, en activant les récepteurs nucléaires, pourrait également influencer la fonction de COG4 en modulant l'expression des gènes liés aux processus de trafic dans le Golgi. Le D-erythro-Sphingosine-1-phosphate, un lipide de signalisation, a la capacité d'activer des voies qui peuvent moduler la fonction de la COG4, ce qui reflète la complexité de la signalisation lipidique dans la régulation du trafic intracellulaire. La curcumine, avec son large spectre d'interactions de signalisation, a également le potentiel d'influencer le réseau de régulation de COG4.
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