LY294002 e Wortmannin, inibendo la PI3K, possono interrompere la segnalazione di AKT, una via che potrebbe intersecarsi con la funzionalità del CCDC104 nella regolazione della crescita e della sopravvivenza cellulare. Analogamente, gli inibitori di MEK come PD98059 e U0126 possono avere un impatto sulla via ERK, un mediatore critico del ciclo e della divisione cellulare, in cui il CCDC104 potrebbe svolgere un ruolo. Anche l'inibizione della JNK attivata dallo stress da parte di SP600125 o della p38 MAP chinasi da parte di SB203580 potrebbe modulare la funzione di CCDC104 se è coinvolto nelle risposte allo stress cellulare. Gli inibitori dell'Aurora chinasi, come ZM-447439, sono noti per influenzare le proteine legate al ciclo cellulare, che potrebbero includere CCDC104 se partecipa ai processi mitotici.
Nel contesto del turnover proteico, Bortezomib può influenzare la stabilità di CCDC104 inibendo il proteasoma, il principale macchinario responsabile della degradazione delle proteine. La tricostatina A altera i modelli di espressione genica inibendo le istone deacetilasi, influenzando il CCDC104 se la sua espressione è cromatina-dipendente. L'inibizione della calcineurina da parte della ciclosporina A potrebbe influenzare le proteine coinvolte nelle vie di risposta immunitaria, il che potrebbe influire sul ruolo del CCDC104 in tali vie. L'inibizione ad ampio raggio delle chinasi da parte della staurosporina potrebbe influenzare lo stato di fosforilazione e, di conseguenza, l'attività di CCDC104.
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