O 12-miristato 13-acetato de forbol, conhecido como PMA, e a genisteína actuam através das vias da proteína quinase C e da tirosina quinase. O PMA induz a PKC, que funciona como um interrutor molecular em numerosas vias de sinalização, conduzindo a um efeito dominó que pode culminar na ativação de proteínas. A genisteína, embora seja principalmente um inibidor da tirosina quinase, pode também exercer efeitos indirectos que promovem a ativação destas quinases e dos seus substratos proteicos. Influenciando ainda mais a atividade proteica, o Resveratrol afecta a SIRT1, uma enzima envolvida nas respostas ao stress celular e no envelhecimento, que modula as funções de outras proteínas. Do mesmo modo, a espermina interage com os canais iónicos, alterando subtilmente o equilíbrio iónico celular e influenciando indiretamente as vias de sinalização que ditam a fosforilação e a ativação das proteínas.
Curiosamente, alguns compostos como a Staurosporina, embora amplamente reconhecidos como inibidores, em doses diferenciadas podem ativar inesperadamente certas cinases, promovendo assim indiretamente a ativação das proteínas. A calicilina A e o ácido ocadaico, como inibidores das proteínas fosfatases 1 e 2A, impedem a desfosforilação das proteínas, mantendo-as efetivamente num estado fosforilado ativo. Esta estratégia de impedir o interrutor de desativação da atividade proteica sublinha a complexa regulação dos processos celulares. O LY294002 e o H-89 contribuem para esta paisagem reguladora modulando a atividade das cinases - o LY294002 através da inibição da PI3K, que pode levar a efeitos a jusante na atividade das proteínas, e o H-89 através da inibição da PKA, induzindo assim potencialmente mecanismos compensatórios que activam outras cinases.
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