A forskolina e o IBMX elevam os níveis intracelulares de cAMP, que por sua vez activam a PKA, uma quinase com capacidade para fosforilar numerosas proteínas. Esta fosforilação pode levar a modificações da atividade proteica, afectando potencialmente proteínas como a C9orf40. Outras moléculas, como o PMA, actuam como activadores da proteína quinase C (PKC), provocando a fosforilação de uma variedade de substratos. Paralelamente, ionóforos como a Ionomicina e o A23187 perturbam a homeostase do cálcio, desencadeando mecanismos de sinalização dependentes do cálcio que podem cruzar-se com os domínios reguladores de proteínas semelhantes à C9orf40. LY294002, U0126 e SB203580 são representantes que têm como alvo o núcleo de cascatas de sinalização como PI3K/AKT e MAPK/ERK. Estes inibidores modulam o estado de fosforilação e a atividade das cinases nestas vias, o que pode ter influência na atividade das proteínas reguladas por estas cascatas.
Além disso, os modificadores epigenéticos, como a tricostatina A e a 5-azacitidina, induzem alterações nos padrões de expressão genética através da inibição das histonas desacetilases e das DNA metiltransferases, respetivamente. Estas alterações na paisagem da cromatina podem, consequentemente, afetar a expressão e a função de uma vasta gama de proteínas. O inibidor da quinase Aurora, ZM-447439, vem juntar-se a este arsenal, influenciando a progressão do ciclo celular e afectando potencialmente as proteínas envolvidas neste processo celular fundamental.
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