LY294002とトリシリビンは、細胞増殖と生存の制御に重要な軸であるPI3K/ACT経路の阻害剤である。これらの化学物質によるこの経路の阻害は、この経路に関連するタンパク質に影響を与える可能性があり、細胞機能にかなりの変調をきたす可能性がある。SP600125、ラパマイシン、スタウロスポリンは、それぞれストレス応答、mTORシグナル伝達、複数のキナーゼを標的とする。これらの経路は、代謝、成長、アポトーシスを含む細胞プロセスの適切な機能に不可欠である。これらの経路を阻害することは、これらの経路に関与する、あるいは影響を受けるタンパク質の活性に広範な影響を及ぼす可能性がある。
PD98059とU0126はMEK酵素の特異的阻害剤であり、ひいては細胞の増殖と分化に極めて重要なMAPK/ERKシグナル伝達経路の阻害剤である。GW5074とChelerythrineは、それぞれc-RafとPKCを標的とし、細胞周期とアポトーシス過程に影響を与える。これらの経路への影響は、これらの経路の一部である、あるいはこれらの経路によって制御されているタンパク質の挙動を変化させる可能性がある。ZM-447439とタプシガルギンは、それぞれ細胞分裂とカルシウムホメオスタシスに影響を与える。ZM-447439によるオーロラキナーゼの阻害は分裂プロセスを混乱させる可能性があり、一方、タプシガルギンによるカルシウムシグナル伝達の混乱は、細胞の生存とシグナル伝達に対する影響のカスケードを引き起こす可能性がある。2-D08によるSUMO化プロセスの阻害は、タンパク質の機能と局在に広範な変化をもたらし、SUMO化プロセスと相互作用する、あるいはSUMO化プロセスによって制御されるタンパク質に影響を及ぼす可能性がある。
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