Les inhibiteurs de C19orf50 sont des composés qui affectent l'activité de la protéine C19orf50 en ciblant divers processus cellulaires qui sont en amont ou font partie intégrante de sa fonction. Les inhibiteurs de l'histone désacétylase, tels que la trichostatine A, le vorinostat, l'entinostat et la romidepsine, agissent en augmentant l'acétylation des histones, ce qui conduit à un état plus détendu de la chromatine. Cet état de relaxation peut réduire la capacité du C19orf50 à accéder et à se lier à ses séquences d'ADN cibles au sein de la chromatine, car le C19orf50 pourrait interagir préférentiellement avec l'ADN sous une forme plus compacte. La structure acétylée de la chromatine peut également affecter le recrutement des cofacteurs nécessaires à l'activité du C19orf50, inhibant ainsi davantage sa fonction.
En outre, des inhibiteurs tels que la 5-Azacytidine, le RG108 et la Décitabine modulent le statut de méthylation de l'ADN. En inhibant l'activité de l'ADN méthyltransférase, ces composés diminuent les niveaux de méthylation de l'ADN, ce qui peut entraver la capacité du C19orf50 à reconnaître et à se lier à ses régions régulatrices cibles de l'ADN méthylé. Cette perturbation des interactions ADN-protéine peut entraîner une diminution de l'activité fonctionnelle du C19orf50. Les inhibiteurs du protéasome tels que le MG132 peuvent entraîner une augmentation des niveaux de protéines susceptibles de se lier au C19orf50 ou à ses cofacteurs et de les séquestrer, ce qui a pour effet d'inhiber davantage son activité fonctionnelle. La modulation du cycle cellulaire par le PD0332991, ainsi que l'inhibition transcriptionnelle par le Triptolide, représentent des stratégies supplémentaires qui conduisent indirectement à une réduction de l'expression du gène cible du C19orf50. L'A-366, qui cible la méthylation des histones, peut modifier le recrutement du C19orf50 sur ses sites de liaison.
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