C10orf132が重要な細胞機能を持つタンパク質をコードしていることが判明し、この機能を調節することに関心がある場合、阻害剤開発のプロセスはタンパク質の構造と機能を定義することから始まる。そのためには、X線結晶構造解析、クライオ電子顕微鏡、NMR分光法などの経験的技術を組み合わせて、タンパク質の三次元構造を決定する必要がある。タンパク質の構造、特に活性部位や機能ドメインの配置を理解することは、合理的な薬剤設計に不可欠である。この構造情報があれば、研究者はタンパク質と特異的に相互作用し、その機能を阻害する可能性のある分子の設計に携わることができる。
次に、化学者たちは、C10orf132タンパク質産物に結合すると予測される一連の化合物の合成に着手するだろう。これらの化合物は、数千から数百万の化合物を迅速にテストできるハイスループットスクリーニング法を用いて、タンパク質に結合する能力をスクリーニングされるであろう。この最初のスクリーニングでヒットした化合物は、構造活性相関(SAR)研究によってさらに評価され、最適化される。この研究では、タンパク質への結合親和性や特異性を高めるために、化合物に系統的な化学修飾を加える。この過程で、分子モデリングやドッキングなどの計算機的手法は、異なる化学基がタンパク質との相互作用にどのように寄与するかを予測する上で有用である。このような設計、合成、試験の反復サイクルを通じて、C10orf132タンパク質産物への結合とその活性の阻害に効果的な分子群を改良することが目標となる。
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