BBP阻害剤には、異なるが相互に関連した生化学的経路を通じてBBPの活性を減弱させる様々な化合物が含まれる。例えば、幅広いキナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、BBP活性化に重要なキナーゼのリン酸化を阻害し、BBP活性を低下させる。化合物LY 294002は、BBPを制御するものを含む様々な細胞プロセスに必須であるPI3K/Aktシグナル伝達経路を標的とし、リン酸化を低下させ、結果としてBBPの機能を低下させる。PD98059やU0126に代表されるMEK阻害剤は、MAPK/ERKシグナル伝達カスケードを特異的に阻害し、BBPの翻訳後修飾や活性を調節することが知られており、その結果BBPの機能が低下する。ラパマイシンやPF 4708671のような阻害剤は、それぞれmTORC1複合体やp70 S6 キナーゼ1を阻害する。これらの複合体は、タンパク質合成や、BBPを活性化するタンパク質の調節に中心的な役割を果たしており、最終的にBBPの活性を低下させる。
トリコスタチンAとボルテゾミブは、BBP活性をさらに低下させるために、異なるメカニズムで作用する。トリコスタチンAがヒストン脱アセチル化酵素を阻害することによって遺伝子発現を変化させ、BBP制御タンパク質のレベルを低下させる可能性があるのに対して、ボルテゾミブは、細胞ストレスを引き起こすミスフォールドタンパク質の蓄積を引き起こし、BBP関連経路をダウンレギュレートする可能性が高い。SB 203580とZM-447439は、それぞれp38 MAPKとオーロラキナーゼを標的としており、両者ともBBP制御に影響を与えうるストレス応答とリン酸化過程に関与している。17-AAGはHsp90タンパク質の機能を破壊し、BBP活性を調節するキナーゼを含むクライアントタンパク質に影響を与え、BBPの機能低下につながる。WZ4003は、BBP活性化に関与する制御タンパク質に影響を与えるキナーゼであるNUAK1の阻害に焦点を当てている。これらの阻害剤は全体として、BBPの機能的活性を低下させるという共通の結果に収束するために、多様な分子メカニズムを利用している。
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