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ZFR CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-407242-ACT | 20 µg | $397.00 |
ヒトZFR(zinc finger RNA-binding protein:亜鉛フィンガーRNA結合タンパク質)は主に核内に局在するRNA結合因子で、スプライソソームやリボヌクレオプロテイン複合体との相互作用を介して、pre-mRNAスプライシングの調節やRNAプロセシングの制御など、転写後遺伝子制御に関与するとされています。転写産物アイソフォームの利用やRNAの運命を制御することで、ZFRは増殖、分化、ストレス応答性遺伝子発現といった細胞状態プログラムに影響を及ぼし得ます。RNAプロセシングの破綻は、がんや神経発達障害、神経変性疾患に共通してみられる特徴であるため、ZFRはRNA制御ネットワークの機構研究において重要な標的となります。ZFRの機能を解析することで、スプライシング関連経路とRNA結合タンパク質がヒト細胞における遺伝子発現出力をどのように協調して制御しているかの理解が深まります。
ZFR CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性ZFRの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
ZFR CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における ZFR 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はZFR転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性ZFRの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のZFR遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるZFR依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびZFR発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるZFR経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。