XRN1 CRISPR/Cas9 케이오 플라스미드 (h): sc-401910

개요

XRN1은 탈캡(decapping)된 전사체를 분해하고 RNA 분해 중간체를 제거함으로써 세포질 mRNA 턴오버를 주도하는, 고도로 보존된 5′→3′ 엑소리보뉴클레이스를 암호화한다. 이는 전사 후 유전자 조절의 핵심 구성요소로서, 탈캡과 엑소뉴클레아제적 분해를 mRNA 감시, 스트레스 과립(stress granule) 동역학, 비정상적 또는 바이러스성 RNA에 대한 선천면역 감지 경로와 연결한다. RNA 품질 관리 및 전사체 재구성을 통해 XRN1은 스트레스와 감염에 대한 세포 반응뿐 아니라 증식과 분화와 같은 더 광범위한 프로그램에도 영향을 미친다. RNA 분해의 조절 이상과 XRN1 활성 저하는 인터페론 신호 변화, 신경발달 관련 표현형, 그리고 암과 관련된 유전자 발현 네트워크 변화와 연관되어 왔다.

XRN1 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h)는 human 세포주에서 XRN1 유전자의 표적 파괴를 위해 설계된 플라스미드 풀입니다. 각 플라스미드는 XRN1 유전자 내의 서로 다른 부위를 표적으로 하는 고유한 단일 가이드 RNA(sgRNA)와 Streptococcus pyogenes Cas9 뉴클레아제를 함께 발현합니다. 또한 이 플라스미드들은 GFP를 암호화하여, 형광 현미경이나 유세포 분석기를 통해 성공적으로 형질전환된 세포를 형광으로 식별하고 농축할 수 있게 합니다.

다중 가이드 설계는 Cas9에 의한 이중 가닥 절단 형성 후 XRN1의 개방 독서 틀(ORF)을 파괴하는 삽입 또는 결실(indel)이 발생할 가능성을 높입니다. CRISPR/Cas9 시스템에 의해 유발된 DNA 절단은 내인성 비동종 말단 결합(NHEJ) 경로를 통해 복구되며, 이는 종종 XRN1 단백질 발현을 소멸시키는 프레임 시프트 돌연변이를 초래합니다.

이 CRISPR 녹아웃 시스템은 XRN1 신호 전달 연구, 기능 유전체학 연구, 암 생물학 연구 및 인간 세포주에서의 치료 반응 평가를 위한 XRN1 결핍 세포 모델을 효율적으로 생성할 수 있게 합니다.

주요 특징

• XRN1 기능에 중요한 XRN1 엑손을 표적하는 sgRNA
  전달을 단순화하기 위해 단일 플라스미드에서 SpCas9 및 sgRNA의 공동 발현
  형질전환된 세포 식별을 위한 GFP 리포터
  녹아웃 효율 향상을 위해 여러 XRN1 게놈 부위를 표적하는 플라스미드 풀
  형질전환을 통한 전달과 호환

설계 변형

CRISPRs +/- HDR

• XRN1 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h) 및 XRN1 CRISPR/Cas9 KO 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는 gRNA는 XRN1 유전자좌 내의 서로 다른 부위를 표적화합니다. 표적화 설계 중 하나 또는 둘 다 이용 가능할 수 있습니다. 구입 가능 여부는 관련 제품을 참조하십시오.
  XRN1 HDR 플라스미드 (h) 및 XRN1 HDR 플라스미드 (h2)에 의해 암호화되는
  HDR 기증자 컨스트럭트는 푸로마이신 내성 카세트와 RFP 리포터를 포함하며, 이는 CRISPR/Cas9 KO 설계에 해당하는 정의된 XRN1 표적 부위에서의 상동성 유도 복구를 지원하기 위해 XRN1 상동성 암으로 둘러싸여 있습니다. HDR 기증자의 재고 여부는 달라질 수 있습니다. 재고 여부는 관련 제품을 참조하십시오.

연구용으로만 사용하세요. 진단 또는 치료용이 아닙니다.