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V-ATPase D CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403291-ACT | 20 µg | $397.00 |
ATP6V1Dは、細胞内膜を隔てたプロトン輸送とATP加水分解を共役させる回転型ATPアーゼである液胞型H\+-ATPase(V-ATPase)のV1ドメインに含まれるDサブユニットをコードします。オルガネラの酸性化を支えることで、V-ATPaseのDサブユニットは、エンドソーム‐リソソームの成熟、オートファジーフラックス、受容体リサイクリング、ならびに分泌経路およびエンドサイトーシス経路におけるpH依存的な輸送に寄与します。さらに、V-ATPase依存的なpH制御は、リソソーム表面でのmTORC1シグナル伝達を含む栄養感知にも影響し、酸性コンパートメント内のプロテアーゼ活性の調節にも関与します。V-ATPase機能および小胞の酸性化の破綻は、プロテオスタシスの異常、神経変性過程、がんに関連する代謝・浸潤表現型の変化と結び付けられており、ATP6V1Dは細胞恒常性の機構研究における有用な結節点となります。
V-ATPase D CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性ATP6V1Dの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
V-ATPase D CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における ATP6V1D 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はATP6V1D転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性V-ATPase Dの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のATP6V1D遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるV-ATPase D依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびATP6V1D発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるV-ATPase D経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。