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TTP Double Nickaseプラスミド (m) | sc-423781-NIC | 20 µg | $410.00 |
マウスのZfp36は、トリステトラプロリン(TTP)をコードしている。TTPはAUリッチエレメントに結合するRNA結合タンパク質で、CCR4–NOTデアデニラーゼ複合体をリクルートすることなどにより、サイトカインや即時早期遺伝子産物を含む多くの不安定mRNAのポリ(A)短縮(デアデニル化)と分解を促進する。転写後段階での遺伝子発現制御を介して、TTPはTNF/NF-κBやMAPK/p38といった経路下流の炎症シグナル出力を形作る。Zfp36/TTP活性の変化は、サイトカイン恒常性の破綻や炎症性表現型と関連し、免疫細胞の活性化、マクロファージ応答、ストレス誘導性のトランスクリプト再編成といった文脈でしばしば研究されている。mRNAターンオーバー・ネットワークの要所として、TTPはRNA安定性が炎症関連病態に関わる遺伝子発現プログラムをどのように制御するかを解明するための、扱いやすい入口となる。
TTP ダブルニカースプラスミド(m)は、mouse 細胞株における Zfp36 座の高特異性編集のために設計された、対となる2つのプラスミドから構成される。各プラスミドは、Cas9 D10Aニカースと、Zfp36内の対向するDNA鎖を標的とする異なるsgRNAを発現する。対向するDNA鎖上の隣接する部位に誘導されると、2つのニカースはオフセットした一本鎖切断を生成し、これらが組み合わさってずれた二本鎖切断を生じさせる。これにより、両方のガイドによる協調的なオンターゲット活性が必要となる。生じたDNA切断は、細胞内の内在性修復経路、特に非相同末端結合(NHEJ)によって修復され、その結果、Zfp36の機能を阻害する挿入または欠失が生じる。標的座標における2つのsgRNAの結合を必要とするこの二重ニッキング法は、編集の特異性を高め、標的精度に対するさらなる制御が求められる用途において、CRISPR戦略を補完するものである。
編集された細胞を効率的に同定するために、1つのプラスミドはトランスフェクトされた細胞集団を蛍光可視化するためのGFPをコードし、もう1つのプラスミドは抗生物質選別用のプロマイシン耐性遺伝子を保有しています。これらの機能により、共トランスフェクトされた細胞集団の効率的な濃縮が可能となり、Zfp36が破壊されたクローンの検証が簡素化されます。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。