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TDP2 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403902-ACT | 20 µg | $397.00 |
ヒトTDP2(tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2)はDNA修復酵素であり、トポイソメラーゼIIの中断(abortive)反応によって生じる5′-ホスホチロシル付加体を除去することで、二本鎖切断形成後のDNA末端を再びライゲーション可能な状態に戻します。この活性は、複製ストレスや遺伝毒性曝露後のゲノム安定性と細胞生存を支え、非相同末端結合(NHEJ)や関連する末端処理因子と協調して働く、より広範な二本鎖切断修復ネットワークの一部として機能します。さらにTDP2は、一部のウイルス系においてVPgの切り離しに関わる役割を介してRNAウイルス複製にも寄与し、宿主—病原体相互作用における重要性も示されています。TDP2機能の異常は、神経発達に関わる表現型やDNA修復欠損症候群と関連づけられており、ゲノム維持機構のメカニズム研究における有用な解析対象となっています。
TDP2 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性TDP2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
TDP2 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における TDP2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はTDP2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性TDP2の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のTDP2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるTDP2依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびTDP2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるTDP2経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。