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SSX5 CRISPR Activation Plasmid (h) | sc-403552-ACT | 20 µg | $397.00 |
SSX5 (Synovialsarkom, X-Breakpoint 5) kodiert ein dem Cancer-Testis-Antigen ähnliches nukleäres Protein, das an der Transkriptionsregulation und an chromatinassoziierten Prozessen beteiligt ist. Mitglieder der SSX-Familie können mit epigenetischen Regulatoren, einschließlich Polycomb-Gruppen-Komplexen, interagieren und dadurch Genexpressionsprogramme beeinflussen, die mit Zellidentität und der Kontrolle der Proliferation verknüpft sind. Eine aberrante SSX5-Expression wurde in mehreren Tumorkontexten beschrieben und wird häufig im Zusammenhang mit SSX-assoziierten Fusionsonkogenen sowie der Antigenbiologie der Immunonkologie untersucht. Daher dient SSX5 als Modell, um Transkriptionsdysregulation, linien-/gewebespezifische Antigenexpression und tumorassoziierte regulatorische Netzwerke zu erforschen.
SSX5 Das CRISPR-Aktivierungsplasmid (h) bietet einen gezielten, nicht-destruktiven Ansatz zur Hochregulierung der endogenen SSX5-Expression, ohne die zugrunde liegende DNA-Sequenz zu verändern.
SSX5 Das CRISPR-Aktivierungsplasmid (h) ist ein aus drei Plasmiden bestehendes synergistisches Aktivierungsmediator-System (SAM), das für eine hocheffiziente, ortsspezifische transkriptionelle Hochregulation des SSX5-Lokus in menschlichen Zelllinien entwickelt wurde. Das System basiert auf einem katalytisch inaktiven Cas9 (dCas9), das zwei inaktivierende Mutationen (D10A und N863A) trägt, welche die Nukleaseaktivität eliminieren, während die DNA-Bindung erhalten bleibt. Dieses dCas9 ist mit VP64, einem potenten Transkriptionsaktivator, fusioniert und wird zusammen mit einem Blasticidin-Resistenzgen zur Selektion koexprimiert. Das zweite Plasmid kodiert das MS2-p65-HSF1-Fusionsprotein, einen sekundären Aktivatorkomplex, der zusammen mit dCas9-VP64 wirkt, sowie ein Hygromycin-Resistenzgen. Das dritte Plasmid kodiert für eine zielspezifische 20-nt-sgRNA, die an zwei MS2-RNA-Aptamere fusioniert ist, welche den MS2-p65-HSF1-Komplex an die Aktivierungsstelle rekrutieren, begleitet von einem Puromycin-Resistenzgen. Die drei Plasmide werden im Massenverhältnis 1:1:1 verabreicht, um eine ausgewogene Expression aller Systemkomponenten zu gewährleisten.
Nach der Assemblierung am Zielort bindet der SAM-Komplex etwa 200 bp stromaufwärts der SSX5-Transkriptionsstartstelle, wo VP64, p65 und HSF1 gemeinsam die Transkriptionsmaschinerie rekrutieren und die Hochregulation der endogenen SSX5-Expression vorantreiben. Im Gegensatz zu nukleaseaktivem Cas9 verursacht dCas9 keine Doppelstrangbrüche und verändert die genomische Sequenz nicht, wodurch der native SSX5-Locus erhalten bleibt und die Untersuchung von SSX5-abhängigen Transkriptionsreaktionen am endogenen Locus ermöglicht wird. Dies macht es zu einem wertvollen Werkzeug für Funktionsstudien, die Identifizierung von Zielgenen und die Modellierung der Wiederherstellung des SSX5-Signalwegs in Tumorzellen mit stillgelegtem oder reduziertem SSX5-Ausdruck.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.