Sox-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-423077

概要

Sox1 は、HMG ボックス型の DNA 結合タンパク質である転写因子 Sox-1 をコードしており、マウス発生における神経外胚葉の初期の規定や、神経前駆細胞としてのアイデンティティ維持に早期から機能します。Sox-1 は、中枢神経系における細胞運命決定、増殖、分化を制御する遺伝子発現プログラムを調節し、神経管のパターニングに関与する SoxB1 を介したより広範な転写ネットワークや経路と統合的に働きます。SOX1 に関連するプログラムの破綻は、異常な神経発生の軌道や、神経由来腫瘍における系譜の不安定性（lineage infidelity）という文脈で研究されており、前駆状態と分化状態のバランスの変化が疾患関連の表現型に影響し得ます。発生制御因子として、Sox-1 は幹細胞研究や発生生物学の系において、神経系へのコミットメントをモデル化するためのマーカーおよび機構的ハブとして頻繁に用いられます。

Sox-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるSox1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Sox1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Sox1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Sox-1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Sox-1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Sox1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Sox-1の機能に不可欠なSox1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Sox1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Sox-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびSox-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Sox1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Sox-1 HDRプラスミド（m）および Sox-1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSox1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSox1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。