Sox-1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-401473

Panoramica

SOX1 codifica il fattore di trascrizione Sox-1, un membro della famiglia SOXB1 che è fortemente espresso nel neuroectoderma e nelle popolazioni di progenitori neurali. Sox-1 si lega al DNA tramite il suo dominio HMG box per regolare programmi genici che controllano la specificazione neurale, il mantenimento dei progenitori e la tempistica della differenziazione, interagendo con reti di segnalazione dello sviluppo e con reti di regolazione della cromatina. Nelle vie cellulari, SOX1 contribuisce a circuiti trascrizionali che coordinano la neurogenesi e la restrizione di linea, includendo un cross-talk con processi di patterning associati a Notch, Wnt e SHH. Una espressione deregolata di SOX1 è stata collegata a stati di sviluppo aberranti ed è studiata in contesti quali tumori della linea neurale e sindromi neurologiche associate ad autoanticorpi, rendendolo un nodo utile per la ricerca meccanicistica.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SOX1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SOX1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SOX1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina Sox-1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SOX1 per lo studio della segnalazione di Sox-1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SOX1 critici per la funzione di Sox-1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SOX1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal Sox-1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal Sox-1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SOX1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal Sox-1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR Sox-1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SOX1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SOX1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.