SOCS-6 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-402344

Panoramica

SOCS6 codifica il suppressor of cytokine signaling 6 (SOCS-6), un membro della famiglia SOCS che attenua la segnalazione mediata da recettori e citochine attraverso il suo dominio SH2 e il reclutamento, dipendente dal SOCS box, di complessi di ligasi dell’ubiquitina. SOCS-6 partecipa alla regolazione negativa delle vie JAK/STAT e delle chinasi tirosiniche dei recettori, influenzando a valle gli output di segnalazione PI3K–AKT e MAPK che controllano proliferazione, differenziamento e sopravvivenza. Modulando la durata del segnale e promuovendo il turnover dei componenti di segnalazione attivati, SOCS-6 contribuisce al mantenimento dell’omeostasi cellulare in contesti immunitari e responsivi ai fattori di crescita. Alterazioni dell’espressione o della funzione di SOCS6 sono state associate a reti di segnalazione deregolate implicate nella trasformazione oncogena e in fenotipi correlati al sistema immunitario, rendendolo rilevante per studi meccanicistici sul feedback di via e sulla terminazione del segnale.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO SOCS-6 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SOCS6 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SOCS6 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SOCS6 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina SOCS-6.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SOCS6 per lo studio della segnalazione di SOCS-6, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SOCS6 critici per la funzione di SOCS-6
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SOCS6 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal SOCS-6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal SOCS-6 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SOCS6. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal SOCS-6 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR SOCS-6 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SOCS6 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SOCS6 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.