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Raver2 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-404340-ACT | 20 µg | $397.00 |
ヒトRAVER2は、Raver2というRNA結合タンパク質をコードしており、ポリピリミジントラクト結合タンパク質(PTBP)ファミリーの制御因子と会合して、pre-mRNAのスプライシング選択に影響を与えます。選択的エクソン利用の調節を通じて、Raver2は細胞のアイデンティティ、分化、ならびにストレス適応的な遺伝子発現を形作るトランスクリプトーム再編成プログラムに寄与します。スプライシング因子ネットワークの変化と、それに続くアイソフォーム切り替えは、神経学的および発生・発達に関わる表現型で繰り返し見られる特徴であり、がんに関連したRNAプロセシングの変化にも関与するとされています。そのためRAVER2は、RNA結合、スプライソーム機能、そして状況依存的な遺伝子発現出力を結び付ける転写後制御経路の一要素(ノード)として研究されています。
Raver2 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性RAVER2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
Raver2 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における RAVER2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はRAVER2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性Raver2の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のRAVER2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるRaver2依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびRAVER2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるRaver2経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。