PRDM8 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-406359

概要

PRDM8（PR/SET domain 8）は、PR/SETドメインを含む転写制御因子をコードしており、発生過程におけるクロマチン状態や遺伝子発現プログラムに影響を与えます。PRDMファミリーの一員として、PRDM8は神経分化、軸索誘導、さらに系譜特異的な転写ネットワーク全般を形作るエピジェネティック制御機構に関連しています。PRDM8関連経路の制御が変化すると細胞運命決定が乱れる可能性があり、神経発達機能障害や、がんに関連するエピジェネティック環境で見られる転写調節異常の文脈でも研究されています。PRDM8を解析することは、クロマチンを介した抑制／活性化、エンハンサー–プロモーター制御、ならびに増殖・分化に及ぶ下流作用の機序解明に資するものです。

PRDM8 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるPRDM8遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、PRDM8内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、PRDM8のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、PRDM8タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、PRDM8シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、PRDM8欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• PRDM8の機能に不可欠なPRDM8エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、PRDM8ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• PRDM8 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびPRDM8 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、PRDM8遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  PRDM8 HDRプラスミド（h）および PRDM8 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはPRDM8ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のPRDM8標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。