PDGF-B CRISPR/Cas9 KOプラスミド (r): sc-437277

概要

PDGF-Bは血小板由来増殖因子（platelet-derived growth factor：PDGF）のサブユニットBをコードしており、分泌型の増殖因子としてホモ二量体またはヘテロ二量体を形成し、PDGFRシグナル伝達および下流のPI3K–AKT経路やRAS–MAPK経路を活性化します。ラット細胞では、PDGF-Bは間葉系細胞の増殖・遊走、周皮細胞（ペリサイト）のリクルート、血管成熟を制御し、細胞外マトリックスのリモデリングや組織恒常性に影響します。PDGF-Bによるシグナルは創傷修復や線維増殖性応答とも交差しており、その制御異常は、心血管および腎生物学に関連する病的血管新生や異常な間質活性化と結び付けられています。PDGF-Bは内皮・血管壁細胞・間質の各コンパートメント間のパラクラインコミュニケーションを調節するため、炎症に伴うリモデリングや腫瘍微小環境のダイナミクスを扱うモデルで広く研究されています。

PDGF-B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（r）は、rat細胞株における遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、PDGF-Bタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、PDGF-Bシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• PDGF-Bの機能に不可欠なエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• PDGF-B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（r）およびPDGF-B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（r2）によってコードされるgRNAは、遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  PDGF-B HDRプラスミド（r）および PDGF-B HDRプラスミド（r2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定の標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。