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Nup98 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-402182-ACT | 20 µg | $397.00 |
ヒトのNUP98は、フェニルアラニン–グリシン(FG)リピートを有するヌクレオポリンであるNup98をコードしており、核膜孔複合体の透過性および選択的な核—細胞質間輸送に寄与する。構造的役割にとどまらず、Nup98はクロマチンや輸送受容体との相互作用を介して、転写調節、RNAプロセシング、細胞周期制御にも関与する。NUP98は、NUP98融合タンパク質を生じる染色体再編成によって血液悪性腫瘍でしばしば関与が示されており、分化や増殖の変化と結び付いた遺伝子発現プログラムの破綻を関連付ける。核輸送と転写制御はストレス応答や系譜(細胞系統)決定と密接に結び付いているため、NUP98は核内構造の制御や腫瘍性転写ネットワークを司る経路の研究において広く解析されている。
Nup98 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性NUP98の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
Nup98 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における NUP98 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はNUP98転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性Nup98の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のNUP98遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるNup98依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびNUP98発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるNup98経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。