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HYPB CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-402789-ACT | 20 µg | $397.00 |
SETD2(HYPB)は、SETドメインを含むヒストンメチル基転移酵素をコードしており、転写が活発な遺伝子の遺伝子本体領域にわたってヒストンH3のリジン36(H3K36)のトリメチル化(H3K36me3)を触媒します。このクロマチンマークは、H3K36me3を「読み取る」リーダー複合体のリクルートを介して、転写伸長をpre-mRNAスプライシング、DNA損傷修復、ゲノム安定性の維持と協調させます。SETD2活性はDNAミスマッチ修復や相同組換え経路にも影響し、エピジェネティックな制御を複製忠実性と結び付けています。SETD2依存的なH3K36メチル化の破綻または制御異常は、クロマチン状態の変化、転写制御の乱れ、ゲノム不安定性と関連しており、さまざまながんや発達性疾患の文脈で観察されています。
HYPB CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性SETD2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
HYPB CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における SETD2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はSETD2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性HYPBの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のSETD2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるHYPB依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびSETD2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるHYPB経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。