HoxC11 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-406796

概要

HOXC11は、ホメオボックス型転写因子HoxC11をコードしており、DNA結合性の調節因子として、遺伝子発現プログラムを配列特異的に制御することで、発生過程における前後軸パターニングおよび領域アイデンティティの形成に寄与します。分化した組織では、HoxC11は補因子やクロマチン制御機構と相互作用し、文脈依存的な転写を形作ることで、細胞の分化状態や系譜関連の転写ネットワークに影響を及ぼし得ます。HOXC11の発現異常は複数の腫瘍状況で報告されており、増殖・浸潤・細胞可塑性に影響するHOX遺伝子ネットワーク全体の変化の一部として、しばしば研究されています。転写調節因子としてのHoxC11は、発生に関わる遺伝子調節回路、細胞アイデンティティのエピジェネティック制御、ならびに腫瘍性リプログラミングの研究において重要な対象です。

HoxC11 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHOXC11遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HOXC11内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HOXC11のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、HoxC11タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、HoxC11シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HOXC11欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• HoxC11の機能に不可欠なHOXC11エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HOXC11ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• HoxC11 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHoxC11 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HOXC11遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  HoxC11 HDRプラスミド（h）および HoxC11 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHOXC11ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHOXC11標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。