HoxA11 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-405264

概要

HOXA11は、ホメオボックス型転写因子HoxA11をコードしており、配列特異的にDNAへ結合する転写調節因子として、発生過程におけるパターン形成や間葉系分化プログラムを制御します。ヒト細胞では、HoxA11は四肢および泌尿生殖器系の形態形成を担う転写ネットワークに寄与し、ステロイドホルモンシグナルやクロマチンリモデリングとの状況依存的なクロストークを介して、子宮内膜間質の脱落膜化にも関与するとされています。HOXA11発現の破綻や調節領域（レギュラトリーランドスケープ）の変化は、生殖関連疾患や発生異常と関連づけられており、さらにHOXクラスターの攪乱は複数のがん種で反復して認められる特徴で、増殖や系譜アイデンティティに影響し得ます。核内の転写調節因子であるHoxA11は、発生や疾患関連モデルにおける遺伝子調節回路やエピジェネティック状態の遷移を解明するための、扱いやすい切り口を提供します。

HoxA11 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHOXA11遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HOXA11内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HOXA11のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、HoxA11タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、HoxA11シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HOXA11欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• HoxA11の機能に不可欠なHOXA11エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HOXA11ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• HoxA11 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHoxA11 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HOXA11遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  HoxA11 HDRプラスミド（h）および HoxA11 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHOXA11ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHOXA11標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。