hnRNP C1/C2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-420894

概要

Hnrnpc は、ヘテロ核リボヌクレオタンパク質C1/C2（hnRNP C1/C2）をコードしている。hnRNP C1/C2は核内に豊富に存在するRNA結合タンパク質で、pre-mRNA上に集合して新生転写産物をパッケージ化し、RNAの運命を規定する。hnRNP Cは転写共役的なスプライス部位選択、mRNA 3′末端のプロセシング、核内保持／核外輸送の決定に関与し、不適切なAluのエクソン化やその他の潜在的（クリプティック）スプライシングイベントに拮抗することでトランスクリプトームの完全性維持にも寄与する。これらの機能を通じて、Hnrnpc はRNA代謝の中核経路と統合され、増殖・分化・細胞ストレス応答に関連する遺伝子発現プログラムに影響を与える。hnRNP Cの機能破綻は、がんや神経変性に関連するモデルで観察されるスプライシング風景の変化と結び付けて報告されており、RNAプロセシング異常の研究における共通の結節点となっている。

hnRNP C1/C2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるHnrnpc遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Hnrnpc内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Hnrnpcのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、hnRNP C1/C2タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、hnRNP C1/C2シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Hnrnpc欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• hnRNP C1/C2の機能に不可欠なHnrnpcエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Hnrnpcゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• hnRNP C1/C2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびhnRNP C1/C2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Hnrnpc遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  hnRNP C1/C2 HDRプラスミド（m）および hnRNP C1/C2 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHnrnpcホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHnrnpc標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。