GP-39 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-402147

概要

CHI3L1 は GP-39（YKL-40）をコードしている。GP-39 はキチナーゼ様ファミリーに属する分泌性糖タンパク質で、酵素活性は持たないものの、細胞外マトリックスの構築、細胞接着、組織リモデリングを調節する。GP-39 はマクロファージ、好中球、線維芽細胞様細胞など複数の細胞種で産生され、炎症シグナル伝達や間質―免疫相互作用との関連が示されている。血管新生や線維化過程の制御にも関与するとされ、慢性炎症や異常なマトリックス代謝回転を伴う状況で頻繁に研究されている。CHI3L1 発現の破綻は、がん関連間質、神経炎症、代謝性炎症や気道炎症など、多様な疾患関連フェノタイプと関連づけられており、経路解析やバイオマーカー機序研究における有用なターゲットとなる。

GP-39 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるCHI3L1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、CHI3L1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、CHI3L1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、GP-39タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、GP-39シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、CHI3L1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• GP-39の機能に不可欠なCHI3L1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、CHI3L1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• GP-39 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびGP-39 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、CHI3L1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  GP-39 HDRプラスミド（h）および GP-39 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはCHI3L1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のCHI3L1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。