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ESE-1 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403728-ACT | 20 µg | $397.00 |
ELF3は、バリア組織における系統特異的な遺伝子発現と分化プログラムを制御する、上皮細胞に限定して発現するETSファミリー転写因子ESE-1をコードします。ESE-1は炎症応答およびストレス応答経路からのシグナルを統合し、細胞極性、細胞間接着(ジャンクション)の構築、増殖を制御する転写ネットワークを調節します。また、MAPK/ERKやNF-κB関連の制御回路とのクロストークも報告されています。ELF3活性の破綻は、上皮恒常性の変化や腫瘍関連の転写状態の変容と関連づけられており、がん性リプログラミング、浸潤に関連する表現型、上皮―免疫相互作用の研究において重要です。DNA結合性の制御因子として、ESE-1は、ヒト細胞モデルにおけるプロモーター/エンハンサーの論理や、文脈依存的な転写出力を解析するための扱いやすい結節点(ノード)となります。
ESE-1 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性ELF3の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
ESE-1 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における ELF3 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はELF3転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性ESE-1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のELF3遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるESE-1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびELF3発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるESE-1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。