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Cytokeratin 20 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401153-ACT | 20 µg | $397.00 |
KRT20はサイトケラチン20(CK20)をコードしており、CK20は上皮の細胞骨格構築や組織特異的な分化プログラムに寄与するI型中間径フィラメントタンパク質です。CK20はケラチンフィラメントの組み立てに関与し、接着結合複合体とのクロストークを通じて、消化管および尿路上皮における細胞極性、機械的耐性、バリア機能を支えます。その発現は上皮成熟の過程で厳密に制御されており、分化状態や細胞骨格リモデリングの変化を反映する系譜マーカーとして一般的に用いられます。KRT20の発現パターンの変化は、がんや炎症の文脈における上皮の制御異常と関連しているため、腫瘍表現型、浸潤に伴う細胞骨格再編成、上皮の可塑性を研究するうえで有用な指標となります。
Cytokeratin 20 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性KRT20の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
Cytokeratin 20 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における KRT20 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はKRT20転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性Cytokeratin 20の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のKRT20遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるCytokeratin 20依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびKRT20発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるCytokeratin 20経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。