CIRP CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-419664

概要

Cirbp は、低温誘導性RNA結合タンパク質（CIRP）をコードしており、mRNAの安定性、輸送、翻訳を調節するストレス応答性のRNAシャペロンです。マウス細胞では、CIRPは低体温、紫外線照射、低酸素、酸化ストレスによって誘導され、ストレス顆粒および関連するリボヌクレオタンパク質複合体内での転写後遺伝子制御に寄与します。CIRPに関連する経路は、標的転写産物を選択的に制御することを介して、細胞ストレス応答、炎症シグナル伝達、ならびに概日および代謝制御と交差します。CIRP活性の破綻は、免疫応答や組織のストレス応答の変化と関連付けられており、そのため Cirbp は、炎症、神経生物学、がんに関連するストレス適応の機構研究に有用な遺伝子座です。

CIRP CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるCirbp遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Cirbp内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Cirbpのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、CIRPタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、CIRPシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Cirbp欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• CIRPの機能に不可欠なCirbpエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Cirbpゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• CIRP CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびCIRP CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Cirbp遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  CIRP HDRプラスミド（m）および CIRP HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはCirbpホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のCirbp標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。