CHD1L CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-404840

概要

CHD1L（chromodomain helicase DNA binding protein 1-like）は、ATP依存性のクロマチンリモデラーであり、転写、複製ストレス応答、DNA損傷修復の過程におけるDNAアクセス性の調節に関与すると考えられています。ヘリカーゼ／ATPase活性およびクロモドメインを介した相互作用を通じて、CHD1Lはゲノム安定性と細胞周期進行に影響するクロマチンダイナミクスの協調に寄与します。CHD1Lの発現変動やコピー数増加は複数の腫瘍で報告されており、がん遺伝子性の転写プログラム、複製ストレス耐性、浸潤性表現型との関連から頻繁に研究されています。これらの特徴により、CHD1Lは、クロマチン依存的な遺伝子発現制御やDNA修復経路選択の解明に有用な標的となります。

CHD1L CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるCHD1L遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、CHD1L内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、CHD1Lのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、CHD1Lタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、CHD1Lシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、CHD1L欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• CHD1Lの機能に不可欠なCHD1Lエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、CHD1Lゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• CHD1L CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびCHD1L CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、CHD1L遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  CHD1L HDRプラスミド（h）および CHD1L HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはCHD1Lホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のCHD1L標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。