C530008M17Rik CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-435830

概要

C530008M17Rik はマウスのタンパク質をコードする遺伝子ですが、現時点では特徴付けが十分ではなく、既存のゲノム資源から得られる機能アノテーションも限られています。予測される遺伝子産物として、細胞種特異的な発現パターンや細胞内での役割の可能性を明らかにする目的で、トランスクリプトーム／プロテオームデータセットの文脈で解析されることが多いです。共発現解析や遺伝学的摂動（perturbation）スクリーニングから得られつつある知見は、実験系に応じて、分化、ストレス応答、あるいは組織特異的な恒常性維持といったより広い細胞プロセスの中に C530008M17Rik を位置付ける手がかりとなります。作用機序に関するデータが乏しいため、標的ノックアウト手法が、経路への関与の解明や、発生生物学および疾患モデルに関連する表現型との潜在的な関連を明らかにするうえで、一般的に用いられています。

C530008M17Rik CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるC530008M17Rik遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、C530008M17Rik内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、C530008M17Rikのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、C530008M17Rikタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、C530008M17Rikシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、C530008M17Rik欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• C530008M17Rikの機能に不可欠なC530008M17Rikエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、C530008M17Rikゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• C530008M17Rik CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびC530008M17Rik CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、C530008M17Rik遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  C530008M17Rik HDRプラスミド（m）および C530008M17Rik HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはC530008M17Rikホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のC530008M17Rik標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。