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Atg13CRISPR激活质粒(h2) | sc-404702-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
人类ATG13基因编码Atg13蛋白,它是ULK1起始复合体的核心组成部分,负责整合来自mTORC1和AMPK的营养与能量信号,从而触发自噬体的形成;Atg13通过与ULK1/2、FIP200/RB1CC1以及ATG101相互作用,协调自噬早期事件和隔离膜(phagophore)的成核过程,进而维持蛋白质稳态、细胞器质量控制与应激适应;ATG13依赖的自噬若发生失调,已被认为与肿瘤生物学、神经退行性变以及炎症信号等相关通路有关,因为自噬通量的改变会影响细胞生存与先天免疫反应;对ATG13进行基因编辑可用于开展自噬起始机制研究、绘制信号串扰图谱,并进行功能基因组学筛选,以在人类细胞模型中定量评估自噬通量、应激敏感性及通路依赖性。
Atg13 CRISPR激活质粒(h2)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性ATG13的表达。
Atg13 CRISPR激活质粒(h2)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的ATG13基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于ATG13转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性Atg13表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的ATG13位点,并能够研究内源性位点上依赖于Atg13的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在ATG13表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟Atg13通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。