ARID1B CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-433726

概要

Arid1bは、ヌクレオソーム配置およびエンハンサーのアクセス性を制御するSWI/SNF（BAF）ATP依存性クロマチンリモデリング複合体のサブユニットであり、ATリッチ相互作用ドメインを含むARID1Bをコードします。クロマチン状態の制御を介して、ARID1Bは細胞運命の決定、増殖、分化を司る転写プログラムに影響を及ぼし、神経発生や系譜（ライン）特異的遺伝子発現において重要な役割を担います。ARID1BはWnt/β-カテニン、Notch、細胞周期制御などの経路と連関するエピジェネティック制御にも関与し、状況依存的な転写出力を形成します。ARID1B機能の破綻は発達障害や神経発達表現型と関連付けられており、SWI/SNF複合体の組成変化は、転写制御異常に関わる疾患モデルにおいて頻繁に研究されています。

ARID1B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるArid1b遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Arid1b内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Arid1bのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、ARID1Bタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、ARID1Bシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Arid1b欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• ARID1Bの機能に不可欠なArid1bエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Arid1bゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• ARID1B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびARID1B CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Arid1b遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  ARID1B HDRプラスミド（m）および ARID1B HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはArid1bホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のArid1b標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。