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TFE3 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401179-ACT | 20 µg | $397.00 |
TFE3(転写因子E3)は、MiT/TFEファミリーに属する塩基性ヘリックス・ループ・ヘリックス/ロイシンジッパー型(bHLH-LZ)の転写因子であり、E-boxモチーフに結合してリソソーム生合成、オートファジー、細胞代謝を制御するプログラムを協調的に調節します。mTORC1依存的な制御との相互作用を通じて栄養・ストレスシグナルを統合し、TFEB/TFE3が駆動するリソソーム関連遺伝子ネットワークと協働して、ベシクル輸送および酸化代謝を調整します。ヒト疾患の生物学においては、TFE3活性の変化がプロテオスタシスの破綻や自然免疫応答の異常と関連し、またTFE3遺伝子の融合や過剰発現は、腎細胞癌の一部サブタイプやその他の腫瘍で反復して認められます。これらの特性により、TFE3は分解代謝経路およびオルガネラ恒常性の転写制御を解析するうえで有用な結節点となります。
TFE3 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性TFE3の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
TFE3 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における TFE3 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はTFE3転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性TFE3の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のTFE3遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるTFE3依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびTFE3発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるTFE3経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。