Plasmide CRISPR/Cas9 KO SSBP2 (h): sc-406745

Présentation

SSBP2 (single-stranded DNA binding protein 2) code un facteur nucléaire de liaison à l’ADN impliqué dans la maintenance du génome et le contrôle de la transcription. Il participe à des programmes cellulaires liés à la réplication et à la réparation de l’ADN, à la régulation du cycle cellulaire et à la différenciation hématopoïétique, et peut influencer l’expression génique via des interactions avec des protéines de liaison aux domaines LIM et des complexes régulateurs associés. Une expression altérée de SSBP2 ou sa perturbation a été rapportée dans de multiples contextes tumoraux, ce qui concorde avec des rôles dans la préservation de la stabilité génomique et la limitation d’une prolifération aberrante. Par conséquent, SSBP2 fait fréquemment l’objet d’études sur la transformation oncogénique, les réponses au stress induit par les dommages à l’ADN et les réseaux transcriptionnels spécifiques de lignée.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO SSBP2 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène SSBP2 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du SSBP2, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert SSBP2 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine SSBP2.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en SSBP2 pour l'étude de la signalisation de SSBP2, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de SSBP2 essentiels à la fonction de SSBP2
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de SSBP2 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le SSBP2 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le SSBP2 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus SSBP2. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le SSBP2 plasmide HDR (h) et le SSBP2 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie SSBP2 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles SSBP2 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.