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RBM38 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403488-ACT | 20 µg | $397.00 |
RBM38(RNA binding motif protein 38)はヒトのRNA結合タンパク質であり、mRNAの安定性、局在、翻訳を制御することで転写後の遺伝子発現制御を調節します。標的転写産物との配列特異的な相互作用を介して細胞周期制御やストレス応答プログラムに関与し、増殖や分化に関連する経路に影響を与えます。RBM38の活性はRNAプロセシングのネットワークとも交差しており、チェックポイント応答に関わる因子の発現を調整することで、p53関連の制御回路を形成し得ます。RBM38発現の失調は複数の疾患関連状況で報告されており、細胞表現型に影響するRNA中心の機構を研究するうえで有用なノードとなります。
RBM38 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性RBM38の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
RBM38 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における RBM38 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はRBM38転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性RBM38の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のRBM38遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるRBM38依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびRBM38発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるRBM38経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。