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PLU-1 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-403771-ACT | 20 µg | $397.00 |
KDM5B は PLU-1(JARID1B)をコードしており、PLU-1 は Jumonji C(JmjC)ドメインを含むヒストンリジン脱メチル化酵素です。主に H3K4me3/2 マークを選択的に除去することで、プロモーター関連クロマチンと転写プログラムを再編成します。PLU-1 は系譜特異的転写因子やクロマチンリモデリング複合体との相互作用を介して、細胞周期の進行、分化状態、複製に連動したクロマチン維持の制御に寄与します。KDM5B 活性の変化は、複数の腫瘍状況におけるエピジェネティックな可塑性や転写の再配線と関連づけられており、増殖や細胞同一性のクロマチン依存的制御を研究するための標的として広く用いられています。ヒト細胞モデルでは、PLU-1 を改変することで、ヒストンメチル化動態と遺伝子発現出力および表現型転換を結び付ける経路の解明が可能になります。
PLU-1 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性KDM5Bの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
PLU-1 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における KDM5B 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はKDM5B転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性PLU-1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のKDM5B遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるPLU-1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびKDM5B発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるPLU-1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。