PGDH CRISPR Activationプラスミド (h): sc-402622-ACT

ヒトのHPGDは、15-ヒドロキシプロスタグランジン脱水素酵素（PGDH）をコードしており、PGE2などの生理活性プロスタグランジンをNAD+依存的に酸化して不活化する律速酵素である。プロスタノイドの代謝回転を制御することで、PGDHはプロスタグランジン／COXシグナルの出力を調節し、炎症、上皮の恒常性、血管新生のシグナル、ならびに組織リモデリングに影響を及ぼす。HPGD活性の変化は局所のエイコサノイドバランスを変動させ、プロスタグランジン代謝の破綻が異常な免疫シグナルや増殖性表現型に関与する状況で、しばしば研究対象となる。プロスタグランジン分解代謝のゲートキーパーとして、HPGDは炎症メディエーター、代謝状態、転写プログラム間のクロストークを解析するうえで有用なノードである。

PGDH CRISPR活性化プラスミド（h）は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性HPGDの発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。

PGDH CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における HPGD 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異（D10AおよびN863A）を有する、触媒活性のないCas9（dCas9）を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。

標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はHPGD転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性PGDHの発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のHPGD遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるPGDH依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびHPGD発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるPGDH経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。