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Pax-6CRISPR激活质粒(m) | sc-422119-ACT | 20 µg | $397.00 |
小鼠 Pax6 基因编码 Pax-6 转录因子,这是一种带有配对盒/同源盒 DNA 结合结构域的调控蛋白,可统筹眼、前脑以及胰腺内分泌系统发育所必需的基因表达程序。Pax-6 与包括 Wnt、Shh、BMP/TGF-β 和 Notch 在内的发育信号网络相互整合,调控祖细胞命运指定、谱系承诺以及神经元分化。Pax6 的剂量或调控活性发生改变会扰乱发育模式建立,并在模型系统中与先天性眼部畸形、神经发育缺陷和内分泌功能障碍相关。作为主调控因子,Pax-6 常被用于研究顺式调控逻辑、染色质状态转换,以及决定细胞命运的转录调控回路。
Pax-6 CRISPR激活质粒(m)提供了一种靶向、非破坏性的方法,可在不改变底层DNA序列的情况下上调内源性Pax6的表达。
Pax-6 CRISPR激活质粒(m)是一个由三条质粒组成的协同激活介导(SAM)系统,旨在对人类细胞系中的Pax6基因座进行高效、位点特异性的转录上调。该系统以一种携带两个失活突变(D10A 和 N863A)的无催化活性的 Cas9(dCas9)为核心,这些突变消除了核酸酶活性,同时保留了 DNA 结合能力。该 dCas9 与强效转录激活因子 VP64 融合,并与用于筛选的布拉西定抗性基因共同表达。第二个质粒编码MS2-p65-HSF1融合蛋白——这一二级激活复合物与dCas9-VP64协同作用,并携带潮霉素抗性基因。第三个质粒编码靶标特异性20 nt sgRNA,其与两个MS2 RNA适配体融合,这些适配体可将MS2-p65-HSF1复合物招募至激活位点,并携带嘌呤霉素抗性基因。这三个质粒按1:1:1的质量比递送,以确保系统所有组分的平衡表达。
在靶位点组装完成后,SAM复合物结合于Pax6转录起始位点上游约200 bp处,VP64、p65和HSF1在此协同作用,招募转录 machinery并驱动内源性Pax-6表达上调。与具有核酸酶活性的Cas9不同, dCas9不会引入双链断裂或修改基因组序列,从而保留了原生的Pax6位点,并能够研究内源性位点上依赖于Pax-6的转录反应,使其成为功能研究、靶基因鉴定以及在Pax6表达被沉默或降低的肿瘤细胞中模拟Pax-6通路恢复的宝贵工具。
仅供研究使用。不用于诊断或治疗。