Os oligonucleótidos Oct-1 Gel Shift são sequências curtas de ADN concebidas para utilização em ensaios de gel shift, uma técnica fundamental em biologia molecular utilizada para estudar as interacções proteína-ADN. Estes oligonucleótidos são derivados da sequência de ligação consensual do fator de transcrição Oct-1, que pertence à família de factores de transcrição com domínio POU (Pit-Oct-Unc). O Oct-1 desempenha um papel crucial na regulação da expressão genética, ligando-se a sequências específicas de ADN, conhecidas como motivos octâmero, localizadas nos promotores dos genes alvo. Ao ligar-se aos seus locais-alvo, o Oct-1 pode ativar ou reprimir a transcrição de genes, dependendo do contexto e da sua interação com outras proteínas reguladoras. Ao utilizar os oligonucleótidos de deslocamento em gel do Oct-1 em ensaios de deslocamento em gel, os investigadores podem investigar a cinética de ligação, a especificidade e a afinidade do Oct-1 a motivos octâmeros em várias condições experimentais. Esta técnica permite a elucidação dos mecanismos moleculares subjacentes à regulação genética mediada pelo Oct-1 e fornece informações sobre as complexas redes de sinalização que regem os processos celulares, como o desenvolvimento, a diferenciação e a proliferação.
Referencias do :
- O fator de transcrição octâmero-1 aumenta a ativação do promotor da UDP glucuronosiltransferase 2B7 humana mediada pelo fator nuclear hepático-1alfa. | Ishii, Y., et al. 2000. Mol Pharmacol. 57: 940-7. PMID: 10779377
- Ligação alelo-específica do fator de transcrição ubíquo OCT-1 aos locais funcionais de polimorfismo de nucleótido único (SNP) no promotor do gene do fator de necrose tumoral alfa (TNFA). | Hohjoh, H. and Tokunaga, K. 2001. Genes Immun. 2: 105-9. PMID: 11393654
- Ligação de factores de octâmero ao IL-5 CLE0 murino em células T primárias e numa linha de células T. | Salerno, MS., et al. 2001. Cytokine. 15: 4-9. PMID: 11509003
- Os inibidores da 3-hidroxi-3-metilglutaril coenzima A redutase aumentam a atividade de ligação e o nível nuclear do Oct-1 em células mononucleares. | Ortego, M., et al. 2002. Eur J Pharmacol. 448: 113-21. PMID: 12144930
- Envolvimento do Oct-1 na regulação transcricional da expressão do gene da beta-caseína na glândula mamária do rato. | Zhao, FQ., et al. 2002. Biochim Biophys Acta. 1577: 27-37. PMID: 12151092
- As proteínas homeodomínio TALE regulam a expressão do gene da hormona libertadora de gonadotropina de forma independente e através de interacções com Oct-1. | Rave-Harel, N., et al. 2004. J Biol Chem. 279: 30287-97. PMID: 15138251
- O Oct-1 e o fator nuclear Y ligam-se ao elemento SURG-1 para dirigir a transcrição do gene do recetor de GnRH do rato basal e estimulado pela hormona libertadora de gonadotropina (GnRH). | Kam, KY., et al. 2005. Mol Endocrinol. 19: 148-62. PMID: 15388790
- A triptolida, um componente ativo do remédio herbal chinês Tripterygium wilfordii Hook F, inibe a produção de óxido nítrico ao diminuir a transcrição do gene da óxido nítrico sintase induzível. | Wang, B., et al. 2004. Arthritis Rheum. 50: 2995-303. PMID: 15457469
- Regulação do promotor do gene CYP4A2 do rato por c-Jun e pela proteína de ligação ao octâmero-1. | Fiala-Beer, E., et al. 2007. Int J Biochem Cell Biol. 39: 1235-47. PMID: 17481938
- Associação da concentração sérica de interleucina-6 com um polimorfismo funcional IL6 -6331T>C. | Smith, AJ., et al. 2008. Clin Chem. 54: 841-50. PMID: 18356242
- A laminina B1 controla as respostas ao stress oxidativo através do Oct-1. | Malhas, AN., et al. 2009. J Cell Biol. 184: 45-55. PMID: 19139261
- Um motivo Oct-1 a montante regula a transcrição induzida por citocinas do gene da óxido nítrico sintase induzível humana. | Park, KS., et al. 2009. J Mol Biol. 390: 595-603. PMID: 19467240
- A atividade transcricional do potenciador do papilomavírus humano tipo 31b é regulada através da interação sinérgica da AP1 com dois novos factores celulares. | Kyo, S., et al. 1995. Virology. 211: 184-97. PMID: 7645210
- O Oct-1 liga-se a elementos promotores necessários para a transcrição do gene GnRH. | Eraly, SA., et al. 1998. Mol Endocrinol. 12: 469-81. PMID: 9544983